Prince of Persia: Rival Swords je upravená verze Prince of Persia: Two Thrones, jejíž příběh Prince zastihne ve chvíli, kdy se s Kaileenou vrací po těžkých chvilkách na Ostrově Času do Babylonu. Místo klidu a míru zde ale naleznou válku. Kaileena je unesena a před očima Prince zavražděna, což vyvolá Písky Času, potažmo Temného Prince, který postupně přebírá vládu nad myslí Prince.